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江苏大学高性能计算平台简介

一、江苏大学高性能计算平台简介

江苏大学高性能计算平台于20167月正式面向全校公开使用。平台包括以下类型的节点:1、计算节点20个,共480核。单节点配置为:2CPU(每个CPU 12核)、64GB内存;2、胖节点1个,共96核。配置为:8CPU(每个CPU 12核)、1TB内存;3GPU节点/MIC节点各1个。集群采用56Gb InfiniBand网互联。平台拓扑见图1

1 高性能计算平台系统拓扑图

二、收费办法

校内计算节点用户

校内胖节点用户

校内GPU/MIC用户

申请账号费

1000//

1000//

共享

实际使用量

每核时0.08

每核时0.16

每块卡2/小时

包年

2万(48核)

9万(96核)

包半年

1.2万(48核)

5万(96核)

独占

包年

10万(10个节点)

包半年

5万(10个节点)

三、软件列表

并行环境软件

序号

软件名

版本

说明及安装路径

1

Ssh脚本

1.2.7

对于新建立的用户,可以使用ssh脚本建立节点间无密码访问环境,具体操作步骤参见相关文档。

安装路径:/opt/SSH

2

Intel MPI


安装路径:/opt/intel

3

Intel C


安装路径:/opt/intel

4

Intel Fortran


安装路径:/opt/intel

5

Intel MKL


安装路径:/opt/intel

6

BLAS


BLAS 库,基本线性代数库(Basic Linear   Algebra Subroutines)。

安装路径:/opt/intel

/opt/intel/mkl/libs   /blacs

7

LAPACK


LAPACK,即线性代数计算子程序包(Linear Algebra   Package)。

安装路径:/opt/intel

/opt/intel/mkl/apps   /scalapack

8

FFTW


FFTW,即(the Fastest Fourier   Transform in the West)库。

安装路径:/opt/intel/mkl/include/fftw

10

pgi

10

/opt/pgi

11

openmpi

1.10.1

/opt/software/openmpi-1.10.1-gnu

12

ansys/fluent/cfx

14.5

/opt/software/ansys_inc/v145

13

starccm

9.06

/opt/software/CD-adapco/STAR-CCM+9.06.009-R8

14

cmake

3.4.1

/opt/software/cmake-3.4.1-Linux-x86_64

15

CPMD

3.13

/opt/software/

16

VASP

5.3.5

/opt/software/vasp-5.3.5

17

abaqus

6.13

/opt/software/simulia/abaqus

18

NAMD

2.1

/opt/software/NAMD_2.10b1_Source

16

gcc

4.8

/opt/software/gcc4.8/gcc

17

lammps

2014.2

/opt/software/lammps

18

gromacs

4.6.7

/opt/software/gromacs-4.6.7

19

openfoam

3.0.1

/home/openfoam/OpenFOAM

20

abinit

8.0.8b

/opt/software/abinit

21

quantum-espresso

6

/opt/software/qe-6.0

四、申办流程

1、了解集群情况及高性能计算平台管理办法(参见关于印发《江苏大学高性能计算平台管理办法(暂行)》的通知),考虑是否满足自己的软硬件要求。

2、填写《江苏大学高性能计算平台用户上机申请表》。

3、交至信息化中心(老图书馆6607室)张老师。

4、信息化中心开具《收款通知单》,申请人凭此单到财务办理项目转账,转账成功后将《收款通知单》的“第一联”交至607室。

5、信息化中心正式开通账号。